Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc6F8VPZ5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms