Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm8005F6YKY3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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