Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms