Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Rnf212F6TQD1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Rnf212F6TQD1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf212F6TQD1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf212F6TQD1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf212F6TQD1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf212F6TQD1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf212F6TQD1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf212F6TQD1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Rnf212F6TQD1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf212F6TQD1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf212F6TQD1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf212F6TQD1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Rnf212F6TQD1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf212F6TQD1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Rnf212F6TQD1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf212F6TQD1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Rnf212F6TQD1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Rnf212F6TQD1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Rnf212F6TQD1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf212F6TQD1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Rnf212F6TQD1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Rnf212F6TQD1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf212F6TQD1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Rnf212F6TQD1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Rnf212F6TQD1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf212F6TQD1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Rnf212F6TQD1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf212F6TQD1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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