Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms