Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7N9

Dnah11, Dynein, axonemal, heavy chain 11, mousemouse

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Length 4,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah11E9Q7N9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Dnah11E9Q7N9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Dnah11E9Q7N9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Dnah11E9Q7N9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Dnah11E9Q7N9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnah11E9Q7N9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms