Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc85cE9Q6B2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc85cE9Q6B2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms