Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DspE9Q557 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
DspE9Q557 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DspE9Q557 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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