Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm20518E9Q548 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm20518E9Q548 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20518E9Q548 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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