Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms