Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20425E9Q035 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms