Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms