Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC035044E0CXF8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms