Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SafbD3YXK2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms