Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ptprz1B9EKR1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms