Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnldc1B2RXZ1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms