Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apba1B2RUJ5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apba1B2RUJ5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms