Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms