Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox1B1APN4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox1B1APN4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms