Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatsperbA2RTF1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms