Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700023F06RikA2AB62 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700023F06RikA2AB62 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms