Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm27029A2A4P4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms