Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1bA1Z198 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms