Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms