Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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