Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv15A0A0A6YYE3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trbv15A0A0A6YYE3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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