Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm5114W4VSN8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm5114W4VSN8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm5114W4VSN8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm5114W4VSN8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm5114W4VSN8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm5114W4VSN8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115 ms