Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gria3Q9Z2W9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gria3Q9Z2W9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gria3Q9Z2W9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms