Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt16Q9Z2K1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt16Q9Z2K1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt16Q9Z2K1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt16Q9Z2K1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt16Q9Z2K1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt16Q9Z2K1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt16Q9Z2K1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt16Q9Z2K1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt16Q9Z2K1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt16Q9Z2K1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt16Q9Z2K1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt16Q9Z2K1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt16Q9Z2K1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt16Q9Z2K1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt16Q9Z2K1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt16Q9Z2K1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt16Q9Z2K1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt16Q9Z2K1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt16Q9Z2K1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt16Q9Z2K1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt16Q9Z2K1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt16Q9Z2K1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt16Q9Z2K1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt16Q9Z2K1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt16Q9Z2K1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt16Q9Z2K1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms