Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T6

Pikfyve, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PikfyveQ9Z1T6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PikfyveQ9Z1T6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PikfyveQ9Z1T6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PikfyveQ9Z1T6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PikfyveQ9Z1T6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PikfyveQ9Z1T6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PikfyveQ9Z1T6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PikfyveQ9Z1T6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PikfyveQ9Z1T6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PikfyveQ9Z1T6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PikfyveQ9Z1T6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PikfyveQ9Z1T6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PikfyveQ9Z1T6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PikfyveQ9Z1T6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PikfyveQ9Z1T6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PikfyveQ9Z1T6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PikfyveQ9Z1T6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PikfyveQ9Z1T6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PikfyveQ9Z1T6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms