Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne6Q9Z140 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne6Q9Z140 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms