Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ArcQ9WV31 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ArcQ9WV31 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ArcQ9WV31 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms