Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni1Q9WUZ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnni1Q9WUZ5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnni1Q9WUZ5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnni1Q9WUZ5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnni1Q9WUZ5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnni1Q9WUZ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnni1Q9WUZ5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnni1Q9WUZ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnni1Q9WUZ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnni1Q9WUZ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnni1Q9WUZ5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnni1Q9WUZ5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnni1Q9WUZ5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnni1Q9WUZ5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnni1Q9WUZ5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnni1Q9WUZ5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnni1Q9WUZ5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnni1Q9WUZ5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnni1Q9WUZ5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnni1Q9WUZ5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms