Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PplQ9R269 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PplQ9R269 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PplQ9R269 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PplQ9R269 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PplQ9R269 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PplQ9R269 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PplQ9R269 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PplQ9R269 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PplQ9R269 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PplQ9R269 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PplQ9R269 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PplQ9R269 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PplQ9R269 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PplQ9R269 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PplQ9R269 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PplQ9R269 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PplQ9R269 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PplQ9R269 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PplQ9R269 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PplQ9R269 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PplQ9R269 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PplQ9R269 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PplQ9R269 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PplQ9R269 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PplQ9R269 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PplQ9R269 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PplQ9R269 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PplQ9R269 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PplQ9R269 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PplQ9R269 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PplQ9R269 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PplQ9R269 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PplQ9R269 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PplQ9R269 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PplQ9R269 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PplQ9R269 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PplQ9R269 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PplQ9R269 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PplQ9R269 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PplQ9R269 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PplQ9R269 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PplQ9R269 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PplQ9R269 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PplQ9R269 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PplQ9R269 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PplQ9R269 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PplQ9R269 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PplQ9R269 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PplQ9R269 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PplQ9R269 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PplQ9R269 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PplQ9R269 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PplQ9R269 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PplQ9R269 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PplQ9R269 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PplQ9R269 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PplQ9R269 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PplQ9R269 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PplQ9R269 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PplQ9R269 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PplQ9R269 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PplQ9R269 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PplQ9R269 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PplQ9R269 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PplQ9R269 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PplQ9R269 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PplQ9R269 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PplQ9R269 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PplQ9R269 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PplQ9R269 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PplQ9R269 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PplQ9R269 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PplQ9R269 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PplQ9R269 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PplQ9R269 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PplQ9R269 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PplQ9R269 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PplQ9R269 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PplQ9R269 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PplQ9R269 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PplQ9R269 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PplQ9R269 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms