Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tubd1Q9R1K7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubd1Q9R1K7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubd1Q9R1K7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubd1Q9R1K7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubd1Q9R1K7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubd1Q9R1K7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubd1Q9R1K7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubd1Q9R1K7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubd1Q9R1K7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubd1Q9R1K7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubd1Q9R1K7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubd1Q9R1K7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubd1Q9R1K7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubd1Q9R1K7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubd1Q9R1K7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubd1Q9R1K7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubd1Q9R1K7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubd1Q9R1K7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubd1Q9R1K7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubd1Q9R1K7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubd1Q9R1K7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubd1Q9R1K7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubd1Q9R1K7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubd1Q9R1K7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubd1Q9R1K7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubd1Q9R1K7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubd1Q9R1K7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubd1Q9R1K7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms