Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtsfQ9R013 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtsfQ9R013 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtsfQ9R013 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms