Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Tnnt3Q9QZ47 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Tnnt3Q9QZ47 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tnnt3Q9QZ47 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tnnt3Q9QZ47 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tnnt3Q9QZ47 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tnnt3Q9QZ47 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tnnt3Q9QZ47 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tnnt3Q9QZ47 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tnnt3Q9QZ47 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tnnt3Q9QZ47 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tnnt3Q9QZ47 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tnnt3Q9QZ47 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tnnt3Q9QZ47 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tnnt3Q9QZ47 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tnnt3Q9QZ47 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tnnt3Q9QZ47 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Tnnt3Q9QZ47 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tnnt3Q9QZ47 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tnnt3Q9QZ47 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tnnt3Q9QZ47 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.4 ms