Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nphp1Q9QY53 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nphp1Q9QY53 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nphp1Q9QY53 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nphp1Q9QY53 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nphp1Q9QY53 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nphp1Q9QY53 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nphp1Q9QY53 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nphp1Q9QY53 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nphp1Q9QY53 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nphp1Q9QY53 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nphp1Q9QY53 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp1Q9QY53 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp1Q9QY53 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nphp1Q9QY53 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nphp1Q9QY53 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nphp1Q9QY53 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp1Q9QY53 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp1Q9QY53 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp1Q9QY53 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp1Q9QY53 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp1Q9QY53 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Nphp1Q9QY53 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms