Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fscn3Q9QXW4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fscn3Q9QXW4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fscn3Q9QXW4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fscn3Q9QXW4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms