Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dkk3Q9QUN9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dkk3Q9QUN9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dkk3Q9QUN9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms