Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr4Q9QUK6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr4Q9QUK6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlr4Q9QUK6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr4Q9QUK6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms