Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tlr5Q9JLF7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tlr5Q9JLF7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tlr5Q9JLF7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tlr5Q9JLF7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tlr5Q9JLF7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tlr5Q9JLF7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tlr5Q9JLF7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tlr5Q9JLF7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tlr5Q9JLF7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tlr5Q9JLF7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tlr5Q9JLF7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tlr5Q9JLF7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tlr5Q9JLF7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tlr5Q9JLF7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tlr5Q9JLF7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr5Q9JLF7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr5Q9JLF7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tlr5Q9JLF7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr5Q9JLF7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr5Q9JLF7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr5Q9JLF7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr5Q9JLF7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr5Q9JLF7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr5Q9JLF7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tlr5Q9JLF7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tlr5Q9JLF7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tlr5Q9JLF7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tlr5Q9JLF7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tlr5Q9JLF7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tlr5Q9JLF7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tlr5Q9JLF7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlr5Q9JLF7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlr5Q9JLF7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlr5Q9JLF7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms