Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Hmgn5Q9JL35 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hmgn5Q9JL35 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hmgn5Q9JL35 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms