Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufaf3Q9JKL4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ndufaf3Q9JKL4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms