Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacng4Q9JJV4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacng4Q9JJV4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacng4Q9JJV4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacng4Q9JJV4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacng4Q9JJV4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacng4Q9JJV4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacng4Q9JJV4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacng4Q9JJV4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacng4Q9JJV4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacng4Q9JJV4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacng4Q9JJV4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms