Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN5

Cpn1, Carboxypeptidase N catalytic chain, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpn1Q9JJN5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpn1Q9JJN5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpn1Q9JJN5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpn1Q9JJN5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpn1Q9JJN5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpn1Q9JJN5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpn1Q9JJN5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpn1Q9JJN5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpn1Q9JJN5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpn1Q9JJN5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpn1Q9JJN5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpn1Q9JJN5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpn1Q9JJN5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpn1Q9JJN5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpn1Q9JJN5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpn1Q9JJN5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpn1Q9JJN5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpn1Q9JJN5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms