Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA9

Ctsr, Cathepsin R, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsrQ9JIA9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtsrQ9JIA9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsrQ9JIA9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsrQ9JIA9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsrQ9JIA9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsrQ9JIA9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtsrQ9JIA9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsrQ9JIA9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsrQ9JIA9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtsrQ9JIA9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms