Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf13bQ9ET35 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf13bQ9ET35 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms