Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms