Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBX2

Pdcl, Phosducin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdclQ9DBX2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdclQ9DBX2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PdclQ9DBX2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PdclQ9DBX2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PdclQ9DBX2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PdclQ9DBX2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PdclQ9DBX2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PdclQ9DBX2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdclQ9DBX2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PdclQ9DBX2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms